De Hypothekers Associatie is de overkoepelende organisatie, waarbij alle vestigingen van De Hypotheker zijn aangesloten. Vanuit deze centrale organisatie in Rotterdam vindt de administratie, coördinatie en ondersteuning van alle vestigingen plaats door een team van ruim 110 medewerkers. De Hypothekers Associatie is een franchise-organisatie. De meer dan 150 vestigingen staan bekend onder de naam De Hypotheker. Eind 2013 is het spaarproduct van de Hypotheker, Solide Koers Internet Sparen, omgezet naar de Internet Spaarrekening van Delta Lloyd.